מנגנון הפעילות של הציטוקינים ההומאופתיים וההורמונים ההומאופתיים, מורכב ובנוי על ריגוש והפעלה של מספר יחידות תא או רצפטורים פלסמיים (בזכות דילולם הגבוה, כמו של ריכוז החומרים הפיזיולוגיים בגוף האדם 6-^10 - 9-^10 של ציטוקינים או 12-^10 של הורמונים. ריגוש רצפטורים מאפשר הפעלה מחדש של שרשרת פעולות, ואיתחול מחדש פעילות ביולוגית בכל המערכת העצבית-חיסונית-אנדוקרינית.
ציטוקינים והורמונים הומיאופתיים עובדים על ידי הבאת מידע למערכת, איך לפעול בכדי שהמערכת תוכל לעשות וויסות עצמי.